Падеж, к которому относится слово, определяют по вопросу. Зададим к слову "ягоды" вопрос "что?", например в предложении "Ягоды были вкусные", следовательно, у слова "ягоды" может быть именительный падеж. Но в предложении "Я ем ягоды" у слова "ягоды" падеж винительный, так как вопрос такой: "я ем что (кого)?".
