Для определения падежа зададим к этому слову вопрос.
Два родных (кого?) брата.
Вопрос кого? в двух падежах. Это родительный и винительный падежи.
У существительных второго склонения (именно к нему относится слово "брат") форма родительного и винительного падежей совпадают. В таких случаях для точного определения падежа нужно подставить вместо этого слова любое существительное 1 склонения. У слов первого склонения во всех падежах формы разные. В винительном падеже в первом склонении окончание -У, а в родительном падеже окончание -Ы.
Слово "сестра" первого склонения.
И у нас будет следующее предложение:
Солнце и Месяц - две родные сестры.
Получается, что слово "брат" родительного падежа.