Рассмотрим все словосочетания:
а) привычка (Какая?) опаздывать - именное словосочетание со связью согласование;
б) кто-то (Какой?) в чёрном - именное словосочетание со связью согласование;
в) дверь (Как?) настежь - именное словосочетание со связью примыкание;
г) портфель (Чей?) его - именное словосочетание со связью согласование;
д) карандаша (Сколько?) три - именное словосочетание со связью примыкание;
е) трёх (Чего?) карандашей - именное словосочетание со связью управление;
ё) по велению (Чьему?) по моему - именное словосочетание со связью согласование;
ж) непричастный (К чему?) к делу - именное словосочетание со связью управление.